07. Strange Land, Savage Heart
Działanie X-Factor wymierzone przeciw mutantom mieszkającym w USA wymusza działania prześladowanych, którzy organizują się i tworzą społeczność Akolitów, która oferuje ochronę i bezpieczeństwo wszystkim potrzebującym. By wymusić na rządzie odpowiednie działania Akolici porywają kandydat na prezydenta, który najgłośniej deklaruje chęć eliminacji odmieńców ze społeczeństwa. Graydon Creed okazuje się bliskim krewnym Nightcrowlera, który podejmuje się zadania uwolnienia przyrodniego brata, ich wspólną matką była Mystic, a jego ojcem jest Sabertooth. X-Man, zobowiązując się występować jako jego obrońca, musi zmienić nastawienia brata i wykazuje, że jego nienawiść spowodowana jest jedynie nienawiścią do rodziców. Sędzia Colosus przychyla się do tego więc inny przywódca Akolitów Exodus uznaje go za zdrajcę co wywołuje walkę między nimi. Niespodziewanie miasto zostaje zaatakowane przez X-Fctor, jednak obecni tu X-Men pomagają w odparciu napaści. W krytycznym momencie Creed podstępnie zabija jednak Exodusa, a Nightcrowler przenosi go na lodowe pustkowie, gdzie zostaje odnaleziony przez X-Factor. Po wszystkim Colosus powraca do X-Men.
08. The Dead Man's Hand
Apocalypse wskrzesił Gambit jako swego Jeźdźcę, ale Cable odnajduje ciało Apocalypse i dowody, że zabił go właśnie Gambit. Nathan sprowadza ciało ich wroga do siedziby X-Men i prosi o pomoc w odnalezieniu jego potencjalnego zabójcy, gdyż może być on teraz kimś zupełnie innym i stanowić zagrożenie. Gambit przejmuje jednak kontrolę nad dowolnymi osobami, więc gdy X-Men się z nim konfrontują Nightcrowler traci nad sobą kontrolę, a Rouge zostaje porwana. Bohaterowie nie odpuszczają i dochodzi do kolejnej nierównej konfrontacji. Tym razem do walki włącza się jednak Profesor X, który wciąga Gambita w walkę psychiczną, w trakcie której okazuje się, że jego duch został pochłonięty przez ducha Apocalypse. Sam Xavier nie jest w stanie mu sprostać, ale do walki dołącza Rouge, która ratuje ukochanego, choć wróg nadal czai się w głębi jego umysłu. Tymczasem Cable nie udaje się wykonać swego zadania, a X-Factor sprzymierza się z nim w tym.
X-Men udają się do celestiańskie sanktuarium by poznać tajemnicę Apocalypse i go zniszczyć. Pojawiają się jednak rządowy X-Factor oraz X-Force z Cable próbując im przeszkodzić i zabić Gambita i ukrytego w nim Apocalypse, dochodzi więc do walki. W krytycznym momencie świadomość odzyskuje Gambit, który dołącza do X-Men i przeważa szalę na ich stronę. Mimo wszystko Cable znajduje sposób by uśmiercić Gambit, ale to tylko uwalnia ukrytego w jego umyśle wroga. Potężny przeciwnik błyskawicznie przejmuje kontrolę nad wszystkimi mutantami, ale Rouge przełamuje czar i siłą swej woli zamyka jaźń Apocalypse w kamieniu.
Koniec drugiego sezonu.






























